Oha, ich sehe gerade, dass das durch ffmpeg erzeugte OGG nur in VLC spielt, in HTML5 nicht. =:/

Warum da nicht oggvorbis automatisch als Ausgabecoder genommen wird, kapier ich nicht. Er muss explizit angegeben werden.
Also so:
ffmpeg -i mein.wav -acodec libvorbis mein.ogg