Hi,

Dein System-Perl sollte die manuell installierten Perl-Varianten gar nicht kennen, solange Du es ihm nicht mitteilst. Damit hast Du die strikte Trennung, die Du Dir wünschst.

Die INC-Pfade werden - soweit ich mich erinner - zur Kompilierzeit des Perls festgelegt.
Wenn Du sie später anpassen willst, musst Du entweder nochmal kompilieren (beim System-Perl prinzip-bedingt schwierig ;-) ) oder in den Skripten @INC anpassen (via use lib qw( /path/to/modules );).

Dein System-Perl sollte ein @INC haben, das die Verzeichnisse unter /usr/lib/perl/ verwendet (oder ähnliches; je nachdem wie der Distributor das eingestellt hat).

Deine manuellen Perls sollten @INCs haben, die die jeweiligen Pfade verwenden; also z.B. /usr/local/perl-5.8.8 für die manuelle Perl 5.8.8 Installation, oder /usr/local/perl-5.10.1 für die manuelle Perl 5.10.1 Installation. Dabei sollte 5.8.8 auch nichts vom 5.10.1 wissen, und umgekehrt. Es sei denn, dass Du das
entsprechend angegeben hast...