Ich benutze für (automatisiert erzeugte) Graphen meist Gnuplot. Das kann verschiedene Ausgabeformate und ist ziemlich flexibel in der Formatierung. Es beherrscht aber keinen grafischen Schnickschnack, ist daher eher für wissenschaftliche Paper oder Statusanzeigen als für Geschäftsgrafiken geeignet. Gibt auch ein paar Perl-Module dazu, z.B. Chart::Gnuplot, die ich aber nicht nutze.