Zum Beispiel mit Chart::Clicker.

Gibt aber noch andere (ältere) Module wie GD::Graph die nicht ganz so schöne Graphen erzeugen. Chart::Clicker hat den Vorteil des es Cairo nutzt zum erzeugen, und auch ausgabeformate wie SVG oder PDF erlaubt.

Ansonsten kannst du natürlich auch Flash Graphen erzeugen. http://teethgrinder.co.uk/open-flash-chart/

JavaScript Bibliotheken gibt es ebenfalls die Graphen erzeugen.