Ich glaube, dass Windows per default gar nicht probiert, sich markierten Text zu merken und anderen Programmen zugänglich zu machen.
D.h. erst müsstest du dir eine Methode ausdenken, wie du "mark&click" als "cpy&paste"-Ersatz unter Windows zum laufen bringst (vielleicht gibt es Tools, die das ermöglichen?), dann kannst du anfangen, dir über die Perl-Schnittstelle Gedanken zu machen.