Wenn die Synchronisation in beide Richtungen erfolgen soll, ist unison IMHO ein passendes Tool. Ich benutze es seit einiger Zeit zur Synchronisation zwischen Desktop und Laptop, wobei auf beiden unabhaengig an Dateien gearbeitet worden sein kann.

Die GUI (unison-gtk) erlaubt uebrigens noch nicht die Konfiguration, nur das Aufrufen und interaktive Bearbeiten des Abgleichs.