Wenn das wirklich Zeilenumbrüche sein sollen, dann ist das eher ein "ALT+10 - Kästchen". ;)
Das ist der normale Zeilenumbruch unter Unix/Linux. Unter Windows ist der Zeilenumbruch \013\010, also quasi ALT+13 und ALT+10. Wenn du also einen Unix-Text und Windows anschaut und das Programm die Unix-Zeilenumbrüche nicht erkennt, dann siehst du so ein komisches Kästchen.

Lösung:
Das Ausgelesene mit $text =~ s/\n/\n/g "behandeln", das sollte die Zeilenumbrüche egal welcher Herkunft in diejenigen des aktuellen Betriebssystems umwandeln.