Thread parse hilfee:-((( (6 answers)
Opened by Gast at 2007-06-29 13:53

Gast Gast
 2007-06-29 13:53
#77993 #77993
ich habe die folgende daten in der datei:(natürlich viele davon in der gleiche Art aber hier nur ein Muster davon)

Code: (dl )
1
2
>gi8886141|gb|AAF80385.1| carbofuran hydrolase 
MALNRIKNSNPSTLPPETPGEGPFMHEHQADILKWIRLADDVYRFRD


das sind 2 zeilen, und mein wunsch wäre die datei aufzumachen dann ändern in dem sie wie unten aussieht :

Code: (dl )
>gi8886141 (|gb|AAF80385.1|) carbofuran hydrolase 


immer nach dem (gi+zahlen) bis | zeichen,
dann davor eine klammer setzten mit leerzeichen auch
dann weiter bis zum nächsten | zeichen
dann die klammer zumachen.
ist schon schwer glaube ich

irgendein parse rule, wäre cool, da ich noob bin würde ich mich auf eine ausführliche hilfe.
danke an alleeee im voraus

edit pq: code-tags hinzugefügt\n\n

<!--EDIT|pq|1183114052-->

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