Es könnte eine Sache des Skopus sein. Wenn du deiner Subroutine nicht alle Variablen aus dem Hauptteil übergibst, die dein anderes Programm, welches du mittels do aufrufst aber benötigt gibt es Probleme.
Du solltest überprüfen, ob deiner Sub alles das als Parameter übergeben wird, was deine anderen Programme brauchen.