ich seh das problem nicht.
datei lib/Foo/Bar.pm - package Foo::Bar
datei lib/Bla/Blubber.pm - package Bla::Blubber

das changelog etc. gilt fuer das gesamte "modul", also fuer
das tar-file, oder die "distribution".

allerdings haben module mit unterschiedlichen packages oft auch
nicht viel miteinander zu tun, deshalb sollte man in
so einem fall ein eigenes paket schnueren.
in der regel hat man in einem paket auch nur ein "top-level-package"