Mit \@headerarr nimmst Du tatsächlich immer wieder eine Referenz auf dasselbe Array.
Mit [ @headerarr ] anstelle dessen nimmst Du immer wieder eine neue Referenz auf ein neues Array mit dem aktuellen Inhalt vom Array @headerarr - das war, was Du suchtest, oder?

(ich bin müde und hab bestimmt wieder was übersehen =))

Mehr Info dazu steht in
perllol
perldsc
perlref
perlreftut