Anstatt einzelner Arrays würde ich Dir eher zu Hashes raten, die du einfacher befüllen kannst. Um verschiedene Statistische Werte zu berechnen, könntest Du Dir mal einzelne Sachen von Statistics::Basic anschauen.

Wenn Du eine "Datenbank" haben willst, aber kein externes Programm, dann könntest Du mit DBI und DBD::CSV arbeiten. Dann hast Du den Vorteil von SQL, brauchst aber kein zusätzliches Programm.