Ich habe neben dem release auch noch ein end in der PDF2 Doku gesehen. Probier das doch mal aus.
Ansonsten musst Du halt aus dem Sub ein eigenes Programm machen, das Parameter übernimmt und dann aus dem Hauptskript mehrmals das Unterskript aufrufen. Das ist zwar schlecht für das Laufzeitverhaltens wegen des Overheads für die Prozessgenerierung, aber für den Speicher sollte es besser sein, außerdem kannst Du dann auch eventuell mehrere PDFs parallel generieren, wenn Du nicht auf das Ende der Subprozesse wartest.