ok, hab das jetzt wieder hinbekommen, sodass es wieder funktioniert, bekomme aber, wenn ich auf commandline das skript ausfuehre folgende Fehlermeldung:
Bio::SearchIO: blastxml cannot be found
Exception
------------- EXCEPTION -------------
MSG: Failed to load module Bio::SearchIO::blastxml. Can't locate XML/SAX.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib/perl5/5.8.8/i686-linux /usr/local/lib/perl5/5.8.8 /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.8/i686-linux /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.8 /usr/local/lib/perl5/site_perl .) at /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.8/Bio/SearchIO/blastxml.pm line 93.
BEGIN failed--compilation aborted at /usr/local/lib/perl5/site_perl/5.8.8/Bio/SearchIO/blastxml.pm line 93.