@docsnyder: Wahrscheinlich möchte Aleks sich eben die ausgeben lassen, die "komisch" aussehen.

@Aleks: Bei den gezeigten Testdaten lässt sich das Problem nicht erkennen. Jage die Testdatei doch mal durch "od -ha" und schau nach, ob da nicht irgendwo ein nicht-druckbares Zeichen drin ist, das man mit cat nicht erkennt.
Leerzeichen können übrigens auch ohne das Substitute keine mehr sein, da schon vom split() alle Leerzeichen und Tabs entfernt werden.