Du müsstest mit Spreadsheet::ParseExcel die Werte aus der Datei holen und mit Spreadsheet::WriteExcel oder Spreadsheet::SimpleExcel neu schreiben...
Im Moment gibt es noch kein Plattformübergreifendes Modul, mit dem man Excel-Dateien bearbeiten kann.

Wenn Du direkt unter Windows arbeitest, dürfte Win32::OLE genau das richtige für Dich sein. Damit kann man direkt auf das Excel-Sheet zugreifen und die Sachen bearbeiten!