Thread Bioperl: remoteblast speichert Output file nicht (18 answers)
Opened by paidopoieo at 2005-12-02 02:27

paidopoieo
 2005-12-02 20:52
#60686 #60686
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Hi Renee
*gg* nein, die leerzeichen waren nicht gewollt, danke
hab die Sequenzen per Hand geblastet, bekomm ich auch output...also hits sind jede menge vorhanden...
wenn ich deinen Code verwende funktioniert das auch....bekomme ausgabe auf commandline und in files, jedoch nur immer die erste Sequenz, es endet in einer endlosschleife.....es lest mir immer nur die erste Sequenz aus....
wenn ich die mehtode
$factory->remove_rid($rid); einbaue um die rid dann laeuft es durch legt mir soviele files an wie sequenzen geblastet wurden, jedoch steht nichts in den files.....
keine Ahnung was ich falsch mache, bin zu dumm, find den fehler einfach nicht....

mfg
Hubert

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