ich versuchs mal zu erklären:

wenn du eine liste übergibst, bekommst du auch eine liste in @_. dabei ist es egal, was in der liste drin steht. wenn du also einen scalar und einen array übergibst, bekommst du eine liste mit dem wert des scalars und den werten des arrays.
du solltest also eine referenz auf das array übergeben. z.b. myfunc( $scalar, \@array );. durch das \ vor der variable beinhaltet der ausdruck jetzt nicht den array, sondern eine referenz auf den array. in der sub könntest du dann folgendermassen an die werte kommen my ( $scalar, $array_referenz ) = @_;.

wie man mit referenzen und komplexeren datenstrukturen umgeht lernst du in perldoc reftut und perldoc perllol