Fuer Win32 gibt es das Modul Win32Util, welches Funktionen zum Feststellen des nicht durch die Taskleiste verdeckt wird. Die Funktion sollte auch korrekt funktionieren, wenn sich die Taskleiste an der Seite befindet.

Fuer KDE gibt es KDEUtil. Ich glaube, fuer GNOME sollte die gleiche Funktion funktionieren.