ähm, halt.
ich lese aus deinem post heraus das du auf deiner lokalen maschiene einen agent laufen hast. so weit so gut.
auf der maschiene auf die du dich als erstes einloggst, also per my $ssh = Net::SSH::Perl->new($host);, läuft da auch ein agent?
beachte! "ssh appsvc1 hostname" wird auf der remotemaschiene ausgeführt, und zwar warscheinlich ohne shell, ohne .profile (das kommt darauf an wie Net::SSH::Perl intern arbeitet).
wenn du ein komando auf einer remotemaschiene ausführst, benutze am besten absolute pfade und gebe alle händisch an, du musst es ja nur ein mal im script machen.