1) Du kannst die Pfade, die in @INC stehen sollten, in den Skripten mit use lib nachtragen:



2) Ist das ein Problem?
Warum möchtest Du den Quelltext der Perl-Module an irgendwelche Server ausgeben? Bist Du Dir da sicher?
Er sollte aber vielleicht auch nicht gleich die Module zum Download anbieten.

Was steht denn in den mime.types zur Endung .pm?
Vermutlich steht in httpd.conf, daß unbekannte Endungen einen Download anbieten sollten.

Um die Darstellung als Text zu erreichen mußt Du mit .pm den mime-type text/plain verknüpfen.