warscheinlich musst du einfach deine httpd.conf abändern. handelt es sich denn bei dem perlscript um ein einfaches script, oder um ein modul für mod_perl? normale, als s.g. CGI ausgeführte scripte, benötigen gar kein mod_perl, sondern nur einen normalen perl-interpreter, den du, da du linux verwendest, höchstwarscheinlich schon installiert hast.

unter der annahme, dass es sich um ein "normales" cgi-script handelt:
stelle sicher, dass der apache darauf zugreifen und es ausführen kann (über die dateirechte).
wenn das immer noch nicht funktioniert, musst du dem apache warscheinlich noch sagen, dass er cgis ausführen soll, dass kannst du z.b. über die zeile

machen. damit sagst du dem apache, dass alle dateien mit .pl und .pm am ende cgi-scripte sind.