Na dann....

Das könnte dann auch vom Webserver abhängen. Dein close STDOUT passiert ja nur in Deinem Perl-Programm, ob der Webserver das überhaupt mitbekommt oder ob er die Ausgabe Deines Programms puffert oder ob er generell auf das Ende Deines Programms wartet, weiß ich nicht.

Und so hängt auch die Lösung Deines Problems vom Webserver ab: Bei einfachem CGI reicht ein fork, um Deinen Langläufer zu starten, bei persistenten Interpretern ist ein "double fork" das gegebene. In beiden Fällen meldet sich Dein CGI-Programm schnell vom Webserver ab und der schickt die Antwort an den Client.