Du hast das gleiche Problem, wie im anderen Thread von heute (Matching mit Klammern geht nicht):
In der Variable $checker1 fehlen die '\' vor den Fragezeichen. Damit werden die Fragezeichen als Regex-Funktionen interpretiert. Du würdest also auf align "ac012345678"> (ohne das '?' vor dem schließenden '>') einen Treffer erhalten.

Du musst in der Regex \Q$checker1\E verwenden, damit die Sonderzeichen escaped warden.