Unter Umständen hat sich da einfach eine API verändert und beim Update auf eine neuere Version von Apache und mod_perl gab's auch neue Modulversionen, die diese Methode nun nicht mehr enthalten.
Wenn dein Script ein Modul laden würde, das es nicht gibt, gäbe es einen anderen Fehler. Welche Apache/mod_perl Version war's vorher, und welche ist es jetzt?