Die csv-Dateien schaun auf den ersten Blick gut aus. Zeilenumbrücke stimmen und alle Zeilen matchen

^\d+,\-?\d+,\-?\d+,\-?\d+,[^,]+,[^,]+,[^,]+,[^,]+,[^,]+$

Schau mal, ob dein $cnt nach der Schleife den richtigen Wert hat. Ansonsten liegt der Fehler evtl. in einem nicht gezeigten Codeabschnitt.