Sobald Du CGI.pm einbindest, kannst Du aus STDIN selbst keine Daten mehr lesen. Es kommt der Request-Header Content-Type (Enctype) ins Spiel und allenfalls, wenn dieser Header NICHT application/x-www-form-urlencoded or multipart/form-data ist, kannst Du die Rohdaten allenfalls über param('POSTDATA') oder param('PUTDATA') erhalten, je nach Request-Method.