2014-11-26T19:43:44 Nexo

Der Browser nimmt bestimmt Cookies an, weil sie ja an einer Stelle gelesen werden, und an einer anderen Stelle nicht.

Mag sein. Ist das deine Vermutung oder hast du das mal mit dem Entwicklertools und Remote Debugger auf dem Android browser überprüft?

2014-11-26T19:43:44 Nexo

In einem Sub werden die beiden Cookies richtig gelesen, in einem anderen Sub nicht, obwohl ich den Code (um Fehler auszuschließen), per Copy and Paste übertragen habe!! Jetzt bin ich völlig ratlos.

Du solltest vielleicht mal nachsehen ob dein CGI-Objekt, aus dem du ausliest, wirklich dasselbe ist oder es in der Zwischenzeit geändert wurde.
Und Testausgaben machen. Und mal im Einzelschritt das Programm durchlaufen, da kannst du dann debuggen.

Und wie Rosti schon sagt, über deine Entwicklungsumgebung (wir wissen nicht was du nimmst) nachdenken, ob die wirklich taugt zum Entwickeln deiner Programme.