Zunächst einmal: du kannst auch unter Windows (in Perl) den Vorwärts-Slash verwenden, brauchst da also nicht auf den Backslash umzustellen.

~ entspricht wohl am ehestern $ENV{USERPROFILE}, der Desktop müsste also "$ENV{USERPROFILE}/Desktop" sein.

Es gibt auch eine spezielle Funktion für Spezial-Ordner wie Desktop, siehe z.B. http://www.perlmonks.org/?node_id=343554