Opened by Hagen at 2014-01-30 14:32
Danke für die schnellen Antworten, da habe ich das entscheidende ja nicht gerafft. Jetzt bekomme ich ein definiertes $1.
"\g" macht da keinen Sinn, hatte da vorher aber eine while schleife und da bleibt er sonst drin hängen. Generell habe ich eine regex möglichst einfach gestrickt, um meinen Fehler zu finden, was ich eingentlich machen will ist aus einer Zeile wie dieser
chr1.fa hg19_refGene exon 67091530 67091593 0.000000 + . gene_id "SGIP1"; transcript_id "NM_032291";
die ersten beiden zahlen zwischen den Tabs zu extrahieren und dann über $1 und $2, drauf zuzugreifen. ich denke das kriege ich jetzt hin.
Grüße
Hagen
Last edited: 2014-01-30 16:16:54 +0100 (CET)
"\g" macht da keinen Sinn, hatte da vorher aber eine while schleife und da bleibt er sonst drin hängen. Generell habe ich eine regex möglichst einfach gestrickt, um meinen Fehler zu finden, was ich eingentlich machen will ist aus einer Zeile wie dieser
chr1.fa hg19_refGene exon 67091530 67091593 0.000000 + . gene_id "SGIP1"; transcript_id "NM_032291";
die ersten beiden zahlen zwischen den Tabs zu extrahieren und dann über $1 und $2, drauf zuzugreifen. ich denke das kriege ich jetzt hin.
Grüße
Hagen
Last edited: 2014-01-30 16:16:54 +0100 (CET)