Die Programmiersprache wird hier nicht direkt der Auslöser sein. Vielmehr liegt es daran, wie optimiert die Dateizugriffe sind. Vielleicht ist es schon ein Problem, dass Du mehrfach den "-d"-Check machst. Vielleicht ist aber auch der Algorithmus komplett anders als bei seinem Programm und muss daher über mehr Verzeichnisse laufen.

Daher würde ich vorschlagen, beide Programme mit strace laufen zu lassen und das Output zu vergleichen.