Verstehe ich das richtig, dass die Quelldatei schon, wenn arabische Zeichen drin vorkommen, eine völlig andere Reihenfolge hat als die anderen? Dann musst du halt:

1. Arabische Zeilen erkennen
2. Die Reihenfolge der Fehler umdrehen
3. Auch das Datum ist ja verkehrt herum
4. Dann erst einfügen.

Und zweiter Kommentar:
Was hat der Backslash in  my $gazetteer_txt_datei="/Shared\ Items/Public/Datenbanken/Gazetteer/test.txt"; zu suchen?