du hast also eine textdatei, in der /pfad/to/skript.pl -i /pfad/datei1.datafield /pfad/datei2.datafield etc. drinsteht?

und du möchtestals ergebnis in einem array haben:
/pfad/to/skript.pl, /pfad/datei1.datafield, /pfad/datei2.datafield
?
so merkwürdig mir das auch vorkommt:
wenn du garantieren kannst, dass in den dateinamen keine leerzeichen vorkommen, ist das ja ganz simpel.
dateiname leerzeichen switch leerzeichen dateiname leerzeichen dateiname etc.
wie kriegen wir das in ein array? naja, scheint man ja offenbar an leerzeichen splitten zu können, mittels der funktion split.
dann schmeist du noch das 2. element aus dem ergebnis raus, da -i ja keine datei ist.
fertig.

falls es doch komplizierter ist, ist dein beispiel zu einfach und du brauchst mehrere.

mal was generelles:
du scheinst zu den menschen zu gehören, die sachen denken, aber ohne es zu merken nur einen teil dessen sagen oder aufschreiben.

wenn du eine frage postest, versetz dich in die lage deines gegenübers, der absolut null ahnung hat, woran du gerade arbeitest und der deine daten nicht sehen kann und zudem nichtmal weiss, wieviel perl du kannst.

lies dir am ende deine frage nochmal durch und denke darüber nach, ob du sie verstehen würdest, hättest du nicht alld diese informationen.