also ich kann nur Config::IniFiles empfehlen, hab da noch mit keinem anderen modul gearbeitet.
Config::INI::Simple scheint auch einen Fehler zu haben, weshalb es nicht auf metacpan.org erscheint und auch im cpan-tool nicht (wurde nicht indiziert).

mit Config::IniFiles kannst du ini-dateien lesen, verändern, schreiben, und kommentare werden dabei beibehalten.

einfacher von der struktur her finde ich yaml, da man damit einfach perl-datenstrukturen abspeichern kann, aber die sind dann von benutzern nicht so einfach zu editieren, da sich leicht fehler wie vergessene spaces und sowas einschleichen.