ja, meine ich!
und wenn du $Data::Dumper::Useqq gesetzt hast, wie ich es vorgeschlagen hatte (leider hast du ja erst jetzt reagiert), dann lässt sich hiermit ausschliessen, dass es sich um versteckte sonderzeichen handelt.
ich nehme ja mal an, das du die wiki-seite gelesen hast, die ich verlinkt habe.

mache vor dem copy eine abfrage, ob die datei existiert und lesbar ist.
perldoc -f -f
perldoc -f -r
sind probleme mit dem plattenplatz auszuschliessen?

ansonsten weiss ich leider keine anderen ratschläge. ich arbeite unter linux, weiss aber, dass dateioperationen unter windows immer etwas anfälliger sind, z.b. wenn noch andere anwendungen eine datei geöffnet haben und sowas.