Das ist etwas her.
Wenn bei NTFS die Dateien komprimiert waren kam es manchmal vor, dass die Dateigröße 0 war.
Linux 2.6.16 und CramFS und NFS2 wurde die Dateigröße auf der Festplatte angezeigt.
Dann gab es Probleme mit dem ext2 IFS Treiber für Windows. Da stimmten die Größe nicht wenn die Dateien zu groß waren.
Samba hatte auch mal die Neigung Dateigrößen nach den belegten Blöcken zu berechnen.
Selbst bei ext2 konnte, wenn man die Blockgröße ändert die Dateigröße um ein paar Byte schwanken.
Ich habe das jetzt nicht aktuell geprüft. Aber ich nutze "stat" nicht als exakte Angabe.