also die datenstruktur wäre erstmal ein hash of hashes of arrays. so würde ich es zumindest machen. es kommt halt auch drauf an, was für eine reihenfolge du brauchst. kann sein, dass du das ganze komplizierter beschreibst, als es ist, weil du keine multi-dimensionalen datenstrukturen in perl kennst.
mir ist nicht klar, was genau bei der ausgabe passieren soll.
offenbar iterierst du über alle vorkommenden parameternamen, und innerhalb dessen über alle values. was soll denn nun ausgegeben werden, wenn nicht alle funktionen dieselben parameter haben und auch eine unterschiedliche anzahl von values? du beschreibst anscheinend genau das als problem, aber die lösung wird sich ergeben, wenn du genau beschreibst, was du dann als ausgabe haben willst.