Poste bitte mal ein minimales Beispiel, mit dem man das von Dir geschilderte Problem nachvollziehen kann.
Gedanklich kann ich es so nicht nachvollziehen.

Wenn in $c ein einfacher Zeilenumbruch steckt, kann $c eq '\n' auch nicht funktionieren.
Denn Du vergleichst mit einem String, der aus den zwei Zeichen "\" und "n" besteht.

Innerhalb einfacher Hochkommata findet keine Interpolation des \n statt; das geschieht nur innerhalb von "".

Also müsste der Vergleich so lauten:  $c eq "\n" .