Ich glaube kaum, dass hier CGI die Schuld zu geben ist...

Du schreibst von CGI; demnach ist ein Webserver im Spiel, der ein error_log schreiben sollte.
Finden sich dort Meldungen, die Dein Problem beschreiben?

Kontrolliere doch mal, ob und was in $mailer drin steht.

CGI verändert(/verschluckt) keine print()-Anweisungen.
In der Regel erscheint alles, was auf STDOUT ausgegeben wird, im Browser.
Wenn Deine print()-Anweisung eben auch im Browser erscheint, ist sie wohl auf STDOUT ausgegeben worden.
Demnach scheint in $mailer etwas falsch zu laufen...

Mangels Code kann man aber nichts konkretes zu Deinem Fall schreiben.