Vielen Dank für alle Antworten.
Unter anderem die Tatsache, dass Data::Dumper das auch nicht korrekt anzeigt hat mich dazu bewogen, die bisherige Struktur als ungeeignet für Perl einzustufen.
Daher habe ich mich entschieden, den Hash anders aufzubauen, um garnicht mit dieser Situation konfrontiert zu sein.