Ich würde ein Deamon schreiben der von perl aus aus gestartet/gestoppt wird und Daten über IPC (Socket oder FIFO) annimmt, die er verarbeitet und absendet, da die Kommunikation etwas Komplexer ist würde sich eine Socketverbindung anbieten. Da kann man auf Hilfen wie "Soap" zurückgreifen um sich um die Datenkonvertierungen keine all zu großen Gedanken machen zu müssen.

C# hat alles schon als fertige Bibliotheken so dass du das "nur noch" zusammenkleben musst. C# ist wie eine Mischung aus C++ und Java, wirklich einfach zu Programmieren.