Wenn ich das richtig sehe, liest ExtUtils::Installed die $VERSION-Variable der Module mittels MM->parse_version(...) aus dem ExtUtils::MakeMaker Paket aus.

Zum einen ist es nicht zwingend so, dass jedes Modul überhaupt eine $VERSION-Variable gesetzt hat und zum anderen ist MM->parse_version(...) ein ziemlicher Hack und funktioniert nicht unbedingt immer. Folglich kann auch nicht zu jedem Modul eine Versionsnummer ermittelt werden.