Wenn du lokal testest, warum dann nicht in einer VM wie VirtualBox gleich unter Linux?
Da ersparst du dir Ärger, wenn bei ActivePerl was nicht geht.

Zu deiner Frage mit dem System-Call. Ja, sicher das geht dann auch.
Du kannst ja zum Signieren, Verifizieren oder was sonst nötig ist, auch openssl aufrufen.
Die Module machen ja auch manchmal nix anderes, rufen halt nur intern die libcrypt über XS auf.