Du meinst Ein Webservice mit einem HTTP-Server? Apache was anderes? Hast du Zugriff auf die Konfiguration, Logs, etc.? Welches System Win? Linux? Mac? BSD?



Mal ein Schuss ins Blaue:
Du könntest zwei virtuelle Hosts einrichten und das Script mittels Link (Hardlink) in beide Verzeichnisse packen.

Du kannat die Teile, die in beiden Varianten gleich sind in Module auslagern und nur die Unterschiede in zwei Scripte packen.

Aber ohne weiter Informationen kann man kaum mehr sagen.