Normalerweise ist im verzeichnis ~/.ssh/ die Konfiguration für SSH zu speichern.

Da Net-SFTP stammt von Net-SSH-Perl ab und dieses liest aus der globalen und lokalen Konfiguration.

Vermutung:
Lege doch erst mal bitte eine lokale Konfiguration für SSH an und teste es mal.


http://www.pro-linux.de/t_netzwerk/ssh.html
http://linux.die.net/man/1/ssh
http://linux.die.net/man/5/ssh_config