Wenn ich das richtig sehe, öffnest du erst eine POP3-Mailbox, mit der du nichts weiter machst, und anschließend eine lokale Mailbox, die dem aktuellen Verzeichnis entsprechen soll (was höchstwahrscheinlich nicht das ist, was du möchtest). Außerdem sind da keine Fehlerabfragen (was liefern beide $mgr->open zurück?). Was ist denn, wenn du auf Messages in $pop zugreifst, statt in $folder?