Du solltest eines der fertigen Module zum parsen von CSV verwenden. Die Vailidierung des Formats wird dir sehr viel leichter fallen, wenn du YAML/JSON oder XML verwendest um dein Regelwerk für den Aufbau des Dokuments zu definieren. Wenn du erstmal das Regelwerk parsen musst, so wie du es darstellst, dann solltest du mit ParseRecDescent o.ä. anfangen. Davon rate ich aber ab solange du kein größere Programmiererfahrung hast.