Nach allem, was ich weiß, hat readdir() schon immer die Verzeichniseinträge in der Reihenfolge ausgegeben, in der sie vorliegen, ohne Sortierung. Eine alphabetische Reihenfolge wäre reiner Zufall, der z.B. dadurch passieren kann, dass Dateien in alphabetischer Reihenfolge in das Verzeichnis kopiert werden.

Ich hoffe für dich, dass nicht zu viele readdir()s im Code vorkommen.