Was der beste Weg ist, hängt wie so häufig vom Anwendungsfall ab. Wo kommen die Daten her? Sollen einfach nur die Daten im Graph dargestellt werden, oder sollen Mittelwerte etc. ermittelt werden? Sind das "einmalige" Daten oder werden die Daten in regelmäßigen Abständen gesammelt? Wie liegen die Daten vor? Kommen sie "von außen" als Textdatei oder werden sie anderweitig von einem Skipt gesammelt?

Ich persönlich verwende die Chart-Module sehr gerne, habe aber auch schon mit RRDTool gearbeitet...