Eine gute Lösung dafür habe cih nciht gefunden. Ich habe unter Windows die Dateizuordnung für .pl und .cgi auf Perl gesetzt, so dass der Shebang egal ist, und im Apache unter WIndows hatte ich es mal irgendwo in der Konfiiguration eingebaut.
Letzteres habe ich nicht mehr, da ich jetzt nur noch den Shebang für *nix-Systeme drin stehen habe. Das funktioniert dann auf beiden Systemen.

Grüße, pktm

EDIT: btw, mach mal das .exe hinten dran weg, das ist falsch. Außerdem musst du PERL klein schreiben.